含经堂遗址现有保护设施历经二十余年风雨侵蚀，目前存在结构老化、防护功能退化等问题，不仅难以满足遗址科学保护要求，部分区域更存在安全隐患。为消除风险隐患，提升遗址保护水平，经国家文物局、北京市文物局正式批复，圆明园将自2025年4月7日起实施含经堂遗址保护展示设施提升改造工程。
鉴于含经堂遗址区域有花卉观赏区，为最大限度减少施工对游客赏花带来的影响，4月7日至牡丹花期结束（5月5日前后），含经堂遗址主体区域（含遗址上牡丹种植区）将临时封闭，遗址南侧、东侧牡丹花圃正常开放，游客朋友可沿外围步道观赏。牡丹花期结束后，含经堂遗址全部区域将封闭施工，遗址周边部分道路将暂时受限，施工结束后道路恢复通行。